先日DBCLSを訪れた際に、特任助教の内藤さんからこのウェブツールの紹介をいただきました。
「統合遺伝子検索GGRNA」
（※ 後日から、私の活用例を紹介しています。→こちら）
核酸やアミノ酸配列についての情報を、高い検索速度で得られることを一つの特徴にしています。これは、あいまい検索を排することで得た特徴であり、配列検索がBLASTよりもずっと高い速度で行うことを可能にしています。
他にも、相補鎖を検索したり（reverse プライマーを考えた際に有用）RNAiを検索したりする機能も搭載されています。
（※ 内藤さんご本人よりコメント： GGRNAは実験系の現場でなるべく使いやすいサイトを目指していますので、ご要望がありましたらいつでもお聞かせください。）
私がご本人からお話を伺っていてとくに面白いと思ったのは、次の問いにも答えることのできるアミノ酸配列検索の機能です。
問．次のアミノ酸配列のうち、自然界に存在するタンパク質中にあるのはどれでしょうか？（大海 忍「第1回 せるてQuiz」細胞工学 Vol. 30, No. 7, pp.766 より引用）
1. AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
2. CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
3. DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
4. EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE
5. FFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFF
6. GGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG
7. HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
8. IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII
9. KKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKK
10. LLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLL
11. MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
12. NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
13. PPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP
14. QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ
15. RRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRR
16. SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
17. TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
18. VVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVV
19. WWWWWWWWWWWWWWWWWWWWWWWWWWWWWW
20. YYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYY
（※「自然界に存在する…..」の意味は、アミノ酸ポリマーを実験的に示したのではなく、遺伝子から翻訳された配列に見いだされるということ。）
答．こちらの記事をご覧頂ければと思います。是非どうぞ。
→ アミノ酸配列クイズ（mesoの実験ノート、2011年8月10日）
